??????蛋白質(zhì)組學本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征,包括蛋白質(zhì)的表達水平,翻譯后的修飾,蛋白與蛋白相互作用等,由此獲得蛋白質(zhì)水平上的關于疾病發(fā)生,細胞代謝等過程的整體而全面的認識。是系統(tǒng)地研究生物學規(guī)律和機制的成熟并且有效的工具。
??????以質(zhì)譜為基礎的定量蛋白質(zhì)組學,主要可以分成兩類,第一種是穩(wěn)定同位素標記的定量蛋白質(zhì)組學,比如iTRAQ;第二種是非標記的定量蛋白質(zhì)組學技術,比如label-free。iTRAQ定性定量結果更為準確,通量較高可同時標記2-8個樣本,但是對樣本數(shù)有一定限制且不適用于低豐度蛋白的定量,適合小樣本量的項目;label-free檢測肽段范圍廣,單次可鑒定和定量較多的蛋白質(zhì),但由于樣品單獨進行質(zhì)譜檢測所以重現(xiàn)性較低,在大量算法的基礎上更適合大量樣本的蛋白組研究。
技術方法 | 優(yōu)點 | 缺點 |
iTRAQ | 定量準確、可信度高 蛋白通量高(8標)、覆蓋度高 自動化程度高、分析時間快、分離效果好 分離能力強、分析范圍廣、定性結果可靠 |
需同位素標記,成本較高 樣本數(shù)受限制,只可平行分析2-8個樣本 樣本處理過程容易引入誤差 只能檢測差異蛋白 |
label-free | 實驗成本低、無需同位素 樣本數(shù)不受限制,適用大樣本 對樣本的操作較少,所需樣本量低 檢測肽段范圍寬,有利于低豐度蛋白質(zhì)檢測 可以鑒定蛋白的有無 |
數(shù)據(jù)處理復雜 對質(zhì)譜結果穩(wěn)定性依賴高 影響重復性和定量準確性 |
??????蛋白質(zhì)組學和轉錄組學都是系統(tǒng)地研究生物學規(guī)律和機制的成熟并且有效的工具,由于生命體是一個多層次、多功能的復雜結構體,所以單一組學技術不能全景地揭示生命活動的本質(zhì)規(guī)律。采用蛋白質(zhì)組學和轉錄組學技術同步檢測蛋白質(zhì)及RNA的整體狀態(tài),并且將這兩個組學的數(shù)據(jù)整合起來分析,不僅能在蛋白質(zhì)水平及轉錄水平兩個不同層次上透視生命活動的規(guī)律與本質(zhì),還能揭示二者之間的相互調(diào)控作用或者關聯(lián)。
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擁有豐富的項目分析經(jīng)驗,至今累計完成 近300個物種5?萬多個樣品的研究
可根據(jù)項目需要選擇合適的分析方案,保障結果精準