在中心法則中,RNA處于重要的中央樞紐地位,轉(zhuǎn)錄組作為生信科研中的“萬金油”,幾乎可以與所有的組學(xué)產(chǎn)品聯(lián)合分析。轉(zhuǎn)錄組代表了基因表達的中間狀態(tài),可以反映諸如轉(zhuǎn)錄調(diào)控、轉(zhuǎn)錄后調(diào)控的機理;蛋白組代表生物體直接功能執(zhí)行狀態(tài),可以反應(yīng)轉(zhuǎn)錄本真實的表達情況;而代謝組可以反映生物體表型的狀態(tài)變化。轉(zhuǎn)錄組+蛋白組+代謝組的多組學(xué)分析可以同時實現(xiàn)從“因”和“果”兩個層面來探究生物學(xué)問題,相互間進行驗證,從海量的數(shù)據(jù)中篩選出關(guān)鍵基因、蛋白質(zhì)及代謝通路,解釋生物過程的復(fù)雜性和整體性,提高文章的水平。
本期文獻秀直播就分享一篇案例,帶領(lǐng)大家進入多組學(xué)聯(lián)合分析的新視野。
本期分享文獻
文獻題目:Multiomics analysis reveals new insights into the apple fruit quality decline under high nitrogen conditions
發(fā)表期刊:《Journal of Agricultural and Food Chemistry》
發(fā)表時間:2021年05月
影響因子:5.279
第一作者:王芬 山東農(nóng)業(yè)大學(xué)
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活動信息
時間:11月26日 16:00
形式:免費線上直播
文獻研究背景
? ? ? 氮是果樹必需礦質(zhì)元素中的核心元素,對果實產(chǎn)量的形成和品質(zhì)的提高具有重要作用。然而,氮肥的過量施用是我國蘋果生產(chǎn)中普遍存在的問題。過量施氮不僅導(dǎo)致氮肥利用率下降和環(huán)境污染問題,還會導(dǎo)致蘋果品質(zhì)下降,影響經(jīng)濟效益。因此研究過量施氮導(dǎo)致蘋果品質(zhì)下降的生理機制,對改變蘋果園氮肥施用現(xiàn)狀、減少氮肥的投入與提高蘋果品質(zhì)具有重要意義。為此,以富士蘋果樹為試材,采用轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)聯(lián)合分析,結(jié)合15N和13C同位素雙標(biāo)記技術(shù),研究了高氮對蘋果碳代謝通路、氮代謝通路、碳-氮營養(yǎng)及果實品質(zhì)的影響,以期為蘋果降氮提質(zhì)提供理論依據(jù)。
本期分享嘉賓
王芬 博士
山東農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院果樹學(xué)博士。研究方向為果樹營養(yǎng)生理與生物信息學(xué)。以第一作者在Journal of Agricultural and Food Chemistry, Science of the Total Environment, Frontiers in Plant Science等期刊發(fā)表論文4篇,累計影響因子24.7。
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